Bezpečnost je zásadním faktorem, který je třeba vzít v úvahu při výběru generátoru vysokého proudu. Zařízení by mělo mít několik bezpečnostních mechanismů, včetně nadproudové ochrany, přepěťové ochrany, ochrany proti zkratu{1}}a ochrany proti přehřátí, aby bylo zajištěno rychlé přerušení napájení-v abnormálních situacích a aby se zabránilo poškození zařízení nebo zranění osob. Kromě toho jsou důležitými ukazateli bezpečnosti také izolační výkon zařízení, konstrukce rozptylu tepla a snadná obsluha.